MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Verminephrobacter eiseniae EF01-2 plasmid pVEIS01

Total Repeats: 99

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008771	GCC	2	6	18	23	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2	NC_008771	AAG	2	6	45	50	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_008771	TGC	2	6	2408	2413	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_008771	CAG	3	9	2519	2527	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_008771	GGC	2	6	2528	2533	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_008771	AG	3	6	2543	2548	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
7	NC_008771	ACC	2	6	2550	2555	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8	NC_008771	GAA	2	6	2582	2587	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9	NC_008771	GAA	2	6	2648	2653	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10	NC_008771	TCAG	2	8	2661	2668	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
11	NC_008771	TAT	2	6	11131	11136	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_008771	TTG	2	6	11146	11151	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13	NC_008771	GCC	2	6	11236	11241	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14	NC_008771	GCA	2	6	11260	11265	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_008771	ATG	2	6	15649	15654	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16	NC_008771	CA	3	6	16052	16057	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
17	NC_008771	CGC	2	6	16101	16106	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
18	NC_008771	TCG	2	6	16129	16134	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_008771	AAG	2	6	16239	16244	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20	NC_008771	CTCA	2	8	16315	16322	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
21	NC_008771	GTC	2	6	16391	16396	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_008771	ATG	2	6	16416	16421	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23	NC_008771	CTTG	2	8	16902	16909	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
24	NC_008771	TAC	2	6	17572	17577	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_008771	CG	3	6	17591	17596	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
26	NC_008771	CAA	2	6	17662	17667	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_008771	CAC	2	6	17784	17789	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
28	NC_008771	CCA	2	6	18252	18257	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
29	NC_008771	TAT	2	6	18358	18363	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_008771	CAA	2	6	19311	19316	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_008771	AAGCG	2	10	19359	19368	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
32	NC_008771	GGC	2	6	19380	19385	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_008771	CTT	2	6	19580	19585	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_008771	CA	3	6	19917	19922	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
35	NC_008771	TGG	2	6	19936	19941	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
36	NC_008771	GCT	2	6	19946	19951	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_008771	TCA	2	6	19957	19962	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_008771	GCC	2	6	20052	20057	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
39	NC_008771	AAG	3	9	20067	20075	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40	NC_008771	CAT	2	6	20127	20132	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_008771	T	7	7	20157	20163	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_008771	ATA	2	6	20202	20207	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_008771	CGT	2	6	21729	21734	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_008771	CGT	2	6	21752	21757	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_008771	CG	3	6	21764	21769	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
46	NC_008771	CGT	2	6	21773	21778	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_008771	CGT	2	6	21796	21801	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_008771	CGT	2	6	21819	21824	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_008771	T	6	6	21856	21861	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_008771	TCT	2	6	21906	21911	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_008771	CTT	2	6	21918	21923	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_008771	TAC	2	6	21928	21933	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_008771	GC	3	6	21934	21939	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
54	NC_008771	C	6	6	21986	21991	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
55	NC_008771	G	6	6	21996	22001	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
56	NC_008771	C	6	6	22023	22028	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
57	NC_008771	C	6	6	22106	22111	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
58	NC_008771	G	6	6	22115	22120	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
59	NC_008771	CAC	2	6	22121	22126	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
60	NC_008771	C	6	6	22149	22154	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
61	NC_008771	CCCG	2	8	22160	22167	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
62	NC_008771	TGC	2	6	22198	22203	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_008771	C	6	6	22228	22233	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
64	NC_008771	CTC	2	6	22298	22303	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
65	NC_008771	CCA	2	6	22322	22327	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
66	NC_008771	T	6	6	22345	22350	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_008771	CCA	2	6	22383	22388	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
68	NC_008771	AAG	2	6	22770	22775	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
69	NC_008771	ACC	2	6	22782	22787	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
70	NC_008771	AG	3	6	22850	22855	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
71	NC_008771	A	6	6	22857	22862	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_008771	GCT	2	6	24347	24352	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_008771	CCT	2	6	24359	24364	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
74	NC_008771	GGC	2	6	24374	24379	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_008771	AGC	2	6	24947	24952	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_008771	AGAGCG	2	12	24975	24986	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
77	NC_008771	CGC	2	6	25008	25013	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
78	NC_008771	GAA	2	6	25847	25852	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
79	NC_008771	AGC	2	6	25867	25872	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_008771	GGC	2	6	25933	25938	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_008771	CAG	2	6	26855	26860	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_008771	CGG	2	6	26920	26925	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_008771	T	6	6	26952	26957	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_008771	GTGCGC	2	12	26967	26978	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_008771	TTG	2	6	28367	28372	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
86	NC_008771	GTG	2	6	28378	28383	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
87	NC_008771	CGA	2	6	28427	28432	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_008771	CTG	2	6	28527	28532	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_008771	T	7	7	28536	28542	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_008771	CGCA	2	8	28572	28579	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
91	NC_008771	AAC	2	6	29826	29831	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_008771	TGA	2	6	30249	30254	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
93	NC_008771	T	6	6	30286	30291	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_008771	GAG	3	9	30331	30339	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
95	NC_008771	GTT	2	6	30396	30401	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
96	NC_008771	GTG	2	6	30426	30431	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
97	NC_008771	CAT	2	6	31060	31065	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_008771	GCA	2	6	31089	31094	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_008771	GCC	2	6	31131	31136	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.